Au cours des années 80, les préoccupations environnementales ont accaparé l'attention des gouvernements et des groupes environnementalistes. La dégradation de l'environnement et les conséquences des activités individuelles et collectives sur le milieu marin ont eu des conséquences importantes telles que fermeture de plages, interdiction de cueillette dans les zones coquillières, contamination toxique, dégradation d'habitats essentiels pour des espèces marines. 

C'est dans ce contexte qu'est apparu, en 1988, Le Plan d'action Saint-Laurent (PASL). Issu de la concertation des gouvernements provincial et fédéral qui ont voulu protéger et mettre en valeur les milieux naturels du Saint-Laurent, le PASL a été reconduit en 1993 sous le nom de "Saint-Laurent Vision 2000".  C'est alors que Stratégies Saint-Laurent (SSL) a vu le jour. Sa mission  était d'impliquer les citoyens dans l'effort de sauvegarde du Saint-Laurent et de mettre sur pied des groupes de concertation en environnement : les Comités de Zones d'Intervention Prioritaire (ZIP).

Le Comité ZIP Baie des Chaleurs a été constitué en 1992 en tant qu'organisme sans but lucratif. Il est l'un des 14 comités ZIP en opération le long du fleuve et du golfe Saint-Laurent. Centré sur l'action, le programme ZIP vise la participation et la concertation des communautés riveraines, et inclut la diffusion d'un bilan des connaissances sur l'état du territoire, une consultation publique ainsi qu'un plan d'action et de réhabilitation écologique (PARE).

Depuis la création du Comité ZIP Baie des Chaleurs, des personnes affiliées à l'agriculture, à l'industrie, à la santé, à l'éducation, à l'administration municipale, aux petites et moyennes entreprises, des biologistes, écologistes et citoyens du milieu se concertent afin de mener à bien des actions de réhabilitation et de protection du milieu marin du territoire de la Baie des Chaleurs – Gaspé-Sud.

Le Comité ZIP Baie des Chaleurs a acquis une grande crédibilité comme point de convergence des dossiers environnementaux régionaux et a développé une bonne expertise en terme de concertation multisectorielle concernant la baie des Chaleurs. Son ancrage dans le milieu est concret et il démontre une implication dans la dynamique de développement régional. Le Comité ZIP agit selon différentes approches : mobilisation, concertation, éducation, catalyseur de projets, etc. L'impact social de l'organisme provient de son influence sur les instances décisionnelles vers une prise en charge et une responsabilisation du milieu pour mieux répondre aux problématiques existantes et pour apporter des solutions intégrées et durables.